橫琴新口岸於2020年8月18日正式開通，截至2021年12月26日已累計驗放出入境旅客超過1,000萬人次，車輛約130萬輛次。而12月24日也錄得最高出入境37,086人次，最高入境20,490人次。最高出入境車輛通關記錄是2021年12月17日共4,470出入境車次。2021年11月橫琴口岸澳門口岸區平均每天出入境約28,700人次，已超過2019年疫情前日均26,000人次，增幅為10%。

因應澳門輕軌延伸橫琴線項目，需要在盾構施工前進行地面加固施工，有關工程將佔用橫琴口岸車輛通關查驗通道，於2021年12月29日至2022年4月15日進行，橫琴口岸珠方臨時車道將局部限制通行。建議駕駛者留意媒體報道，以及透過治安警察局及交通事務局的實時資訊掌握口岸車流情況，錯鋒出行，兩地牌駕駛者在高峰期可考慮選擇使用其他口岸。

 隨著疫情防控常態化和澳門單牌車審批配額的放開，經橫琴口岸出入境的車輛通關量一直保持高位，2021年11月車輛日均通關量約3,600輛次，其中澳門單牌車日均通關量穩定在2,000輛次以上，最高超過2,900輛次。橫琴口岸出入境車輛高峰時段，平日入境8:00-9:00，出境17:00-20:00；節假日入境17:00-20:00，出境10:00-13:00。

現時，珠澳口岸相關部門正研究更快捷方便的通關模式。為配合日後發展需要，該口岸的旅檢大廳已分別預留可增設查驗通道的空間，永久車道2022年底建成後，將設有出入境各9條客車車道和6條貨車車道，以及隨車驗放廳。而隨車驗放廳出入境各設有2條人工查驗通道和8條合作自助查驗通道，乘客不再需要繞道經旅檢大廳通關。未來，橫琴口岸將大大提升通關效率，進一步促進珠澳兩地人員流動，助力橫琴粵澳深度合作區的建設及發展。